Klorheksidin ağız içinde, dil ve diş üzerinde renk değişikliklerine neden olabilir. Dil üzerindeki renk değişikliği, yüzeysel hücreler üzerindeki glikoproteinlerin pigmentasyonuna bağlıdır.
Klorheksidin kullanımı kesildikten sonra boyanmış hücre katmanlarında deskuamasyon gerçekleşeceğinden renk değişikliği kendiliğinden ortadan kalkar.
Dişler üzerindeki renk değişikliği dişe tutulan salya kökenli glikoproteinlerin ve diğer eklentilerin boyanması ile meydana gelir.
Söz konusu yakınmalar, aşırı plak birikimi olanlarda daha fazladır.
Ayrıca yüzeyi pürüzleşmiş diş olguları ve pürüzlü diş yüzeyleri glikoproteinlerin tutunrnasına elverişli oldukları için daha tazla boyanırlar ve böylece renk değişikliği gözlenir. Diş yüzeyindeki renk değişiklikleri hastaların diş macunları ile ağız temizliği yapabilecekleri duruma gelmeleri ile büyük çapta ortadan kaldırılır.
Pürüzlü diş yüzeyleri ve pürüzlü dolgularda kalan renk değişiklikleri diş hekimi tarafından kolaylıkla giderilebilir.
Ender de olsa bazı hastalarda klorheksidin glukonat gargara ile tedavi sırasında, tad almada değişiklikler oluşabilir.
Tad alma duyusundaki değişikliklerin devamlı olduğu bir olgu bildirilmemiştir. Çok düşük oranda olmak üzere, klorheksidin glukonat gargara kullanımı sırasında alerjik deri reaksiyonları görülebilir.
