Genellikle sultamisilin iyi tolere edilir. Tedavi süresince gözlenen yan etkiler normal olarak tolere edilir. Çok sık olmamakla birlikte bulantı, kusma, diare, deri döküntüsü, kaşıntı, anemi, trombositopeni, eozinofili ve lökopeni görülebilir. Bu belirtiler geçici olup ilaç kesilince kaybolurlar ve duyarlılık reaksiyonları olarak kabul edilirler. Ayrıca karaciğer enzimlerinde yükselmeler olabilir.
Gastrointestinal sistem: Ampisilin/sulbaktam veya sultamisilin kullanımına bağlı olarak bulantı ve diare bildirilmiştir. Nadiren psödomemranöz kolit bildirilmiştir.
Deri: Ampisilin/sulbaktamın klinik çalışmalarında deri raşı bildirilmiştir.
Ayrıca içerdiği ampisiline bağlı olarak agranülositoz hipotrombinemi, nötropeni, trombositopeni, nöbetler, psödomembranöz kolit, tad bozukluğu, süperenfeksiyonlar, renal bozukluk, adult respiratuar distress sendromu, pemfigus vulgaris, deri raşları, stevens-johnson sendromu, toksik epidermal nekroliz, anaflaksi, ototoksisite görülebilir.