Targocid® genellikle iyi tolere edilmektedir. Yan etkiler nedeniyle tedavinin kesilmesi nadirdir ve ortaya çıkan yan etkiler genellikle hafif ve geçicidir. Ciddi yan etki nadiren ortaya çıkmaktadır. Bildirilen advers reaksiyonlar aşağıda belirtilmiştir. Lokal reaksiyon: eritem, lokal ağrı, tromboflebit, i.m. uygulama ile enjeksiyon yerinde abse. Aşırı duyarlık: deri döküntüsü, kaşıntı, ateş, titreme, bronkospazm, anafilaktik reaksiyonlar, anafilaktik şok, ürtiker, anjiyoödem, nadir olarak da eksfoliyatif dermatit, toksik epidermal nekroliz ve Stevens-Johnson sendromu dahil olmak üzere eritema multiforme. Gastrointestinal: bulantı, kusma, diyare. Kan: nadir vakalarda geri dönüşümlü agranülositoz, lökopeni, nötropeni, trombositopeni, eozinofili.
Karaciğer fonksiyonları: artmış serum transaminazları ve/veya alkalen fosfataz. Böbrek fonksiyonları: serum kreatinininde geçici yükselmeler, böbrek yetersizliği. Merkezi sinir sistemi: sersemlik, başağrısı ve intraventriküler uygulama ile nöbetler. İşitme/denge: işitme kaybı, tinnitus ve vestibüler bozukluk. Diğer: süperenfeksiyon (duyarlı olmayan mikroorganizmaların aşırı üremesi).
