- Siprofloksasin 18 yaşın altındaki çocuklarda, juvenillerde, hamilelerde ve emziren kadınlarda kullanım emniyeti ile ilgili yeterli delil bulunmdığı için kullanılmamalıdır. Yaşlılarda ise dikkatli kullanılmalıdır.
- Diğer kinolonlar gibi siprofloksasain de SSS stimulasyonuna neden olur., bu nedenle siproflaksasin santral sinir sistemi bozukluğu olan (serebral ateroskleroz, epilepsi gibi) durumlarda büyük dikkatle kullanılmalıdır.
- Bazı hastalarda ciltte kızarıklıklar, ateş gibi belirtilerle başlayan aşırı duyarlılık reaksiyonları oluşturabilir. Bu gibi durumlarda ilaç kesilmelidir.
- Kristalüri riski nedeniyle aşırı lakali idrardan kaçınmalı, bol miktarda sıvı alımına dikkat etmelidir.
- Diğer geniş spektrumlu antibiyotiklerde olduğu gibi, uzun süreli kullanımlarda duyarlı olmayan mikroorganizmaların çoğalmasına bağlı olarak süperenfeksiyon gelişebilir. Bu gibi durumlarda gerekli önlemler alınmlıdır.
- Kullanım süresince karaciğer fonksiyontestleri yüksek çıkabilir, fakat genellikle geçicidir.
- Geriatride renal fonksiyon azaldığı için doz ayarlaması yapılmalıdır.
- Hepatik renal fonksiyon bozukluğunda doz azaltılmasına dikkat edilmelidir.
- Siprofloksasin baş dönmesi ve sersemlik yapabilceğinden araç ve makine kullanan veya dikkat gerektiren işler ile uğraşan kişiler uyarılmalıdır.