Lansoprazol sitokrom P450 sistemi ile metabolize olur. Çalışmalar, sağlıklı kişilerde lansoprazolün warfarin, antipirin, indometasin, aspirin, ibuprofen, fenitoin, prednison, aliminyum-magnezyum hidroksid antiasitleri veya diazepam ile etkileşmediğini göstermiştir. Lansoprazol, teofilin ile birlikte uygulandığında, teofilin klirensinde hafif bir artış görülmüştür. Bu etkileşim klinik açıdan önemli olmasa da, lansoprazol verildiğinde veya kesildiğinde her hastada klinik açıdan etkili kan seviyelerinin garantisi için, teofilin seviyelerinin tekrar titrasyonu gerekebilir.
Lansoprazolün sukralfat ile beraber verilmesi, absorpsiyonunu geciktirmiş ve lansoprazol biyoyaralanımını %30 düşürmüştür. Dolayısıyla, lansoprazol, sukralfattan en az 30 dk. önce alınmalıdır. Lansoprazol, alüminyum-magnezyum hidroksit antiasid mühtahzarlarından 1 saat sonra uygulandığında, Cmax değerine istatiksel olarak önemli bir etkisi olmamaıştır.
Lansoprazol derin ve uzun-süreli bir gastrik-asit sekresyonu inhibisyonuna sebep olduğu için, gastrik pH'ın biyoyaralanımında belirleyici bir etken olduğu ilaçların absorpsiyonunu etkilemesi teorik olarak mümkündür.