Sisplatin, sefaloridin, kanamisin, amikasin, neomisin, polimiksin B, kolistin, paromomisin, streptomisin, tobramisin, vankomisin ve viomisin gibi potansiyel olarak nörotoksik ve/veya nefrotoksik ilaçların eşzamanlı olarak veya gentamisini takiben kullanılmasından kaçınılmalıdır. Gentamisinin, etakrinik asit ve furosemid gibi güçlü diüretiklerle eşzamanlı kullanımından kaçınılmalıdır, çünkü bazı diüretikler kendi başlarına ototoksisiteye neden olabilirler. Buna ek olarak, intravenöz uygulandıklarında diüretikler, serumdaki ve dokudaki antibiyotik konsantrasyonunu değiştirerek aminoglikozid toksisitesini artırabilirler. Aminoglikozidlerin ve sefalosporinlerin konkomitan uygulanmalarından sonra nefrotoksisitenin arttığı bildirilmiştir. Anestezi ilaçları almış veya süksinilkolin, tübokürarin veya dekametonyum gibi nöromusküler blok yapan ilaçları kullanan veya büyük miktarda sitratlı kan transfüzyonu yapılmış hastalara aminoglikozid uygulanırken, nöromusküler blok veya solunum felci ihtimali gözönünde bulundurulmalıdır. Gentamisin ve karbenisilinin in vitro olarak karıştırılması gentamisinin hızlı ve anlamlı bir biçimde inaktive olmasına yol açmakla birlikte, böbrek fonksiyonu normal insanlarda her iki ilaç farklı yollardan uygulandığında böyle bir etkileşim olduğu gösterilmemiştir. Gentamisinle eşzamanlı olarak karbenisilin uygulanan, şiddetli böbrek yetersizliği bulunan hastalarda, gentamisinin serum yarı-ömründe bir azalma olduğu bildirilmiştir.