Gansiklovirin plazma proteinlerine bağlanması yaklaşık % 1-2 olup, bağlanma yeri değiştirilmesi şeklinde ilaç etkileşimleri beklenmemektedir. probenesit ve renal tübüler sekresyon veye emilimi inhibe eden diğer ilaçlar; gansiklovir'in renal klirensini düşürebilir, plazma yarı ömrünü uzatabilir. Ayrıca kemik iliği, spermatogenia ve deri ile gastrointestinal mukozanını erminal tabakaları hızla bölünene hücre topluluklarının replikasyonunu inhibe eden ilaçların; Cymevene ile birlikte; önce veya dahasonra kullanıldıklarında, kombine toksik etki göstermeleri mümkündür. Dapson, pentamidin, fluositizin, vinkristine, vinblastin, adriamisin, amfoterisin b, trimetoprim/sulfametoksazol kombinasyonları veya diğer nükleosid analogları gibi ilaçların Cymevene ile birlikte kulanılmaları ile ilave toksik durumu ortaya çıkar bu ilaçların Cymevene ile kombinasyonundan elde deilecek faydanın zarardan fazla olması durumunda uygulanabilir. Zidovudin ve cymenenin her ikiside nötropeni, ye neden olabileceklerinden, gansiklovir ile indüksüyon tedavisi sırasında bu iki ilacın birlikte verilmemeleri önerilir. Cymevene ile birlikte imipenem silastatinler kullanıldığında, jeneralize nöbetleri oluştuğu rapor edilmiştir.Bu ilaçlar yalnızca riskleri değerlendirildikten sonra Cymevene ile uygulanır.