Seyrek olmakla birlikte aşağıdaki yan etkiler görülebilir.
Gastrointestinal : Diyare, gastirit, stomatit, bulantı-kusma, glossit, enterokolit
ve pseudomembranöz kolit.
Hipersensitivite Reaksiyonları : Cilt kızarıklığı, ürtiker, eritema multiforme gibi
hafif aşırı duyarlılık reaksiyonları görülebilir. Oral penisilinlerle, ciddi akut
hipersensitivite reaksiyonları da (anaflaktik reaksiyonlar) meydana gelebilir. Bu durum acil
tedaviyi gerektirir.
Karaciğer : Ampisilinle tedavi edilen hastaların bazılarında serum transaminazlarında
(SGOT) hafif yükselme bildirilmiştir. Ancak bu bulgunun önemli olup olmadığı bilinmemektedir.
Kontrollü çalışmalarda, bakampisilin ve ampisilinin arasında, karaciğer fonksiyon testi
anormallikleri insidansı yönünden bir fark bulunmamıştır.
Hemik ve Lenfatik Sistem : Penisilin tedavisi sırasında anemi, trombositopeni,
trombositopenik purpura, eozinofili, lökopeni gibi reaksiyonların olabileceği bildirilmiştir.
Bu reaksiyonlar genellikle tedavinin kesilmesiyle düzelir. Bu reaksiyonların hipersensitivite fenomeni olduğuna inanılmaktadır.