Tabletler ağızdan bir miktar sıvı ile alınmalıdır. Günlük doz 50 mg'dır.Tedaviye normalde siklusun 5. günü, amenoreli kadınlarda ise herhangi bir gün başlanıp 5 gün süre ile klomifen sitrat verilir. İlk tedavi siklusunda ovülasyon olmuş ancak gebelik görülmemişse detaviye aynı dozla 2-3 siklus daha devam edilir. Ancak ovulasyon görülmemişse ise, bir sonraki siklusta doz iki katına (2 x 50 mg/gün) çıkartılır ve bu tedavi 3-4 siklus sürdürüldüğü halde ynıt alınmaz ise tedavi kesilir.
Literatürde dozun 250 mg'a kadar yükseltidiğine dair veriler mevcut olmasına karşın yüksek dozların veya uzun süreli tedavinin over büyümesine neden olabileceği unutulmamalıdır, yine de en uygun dozaj şemsı hastanın gelişimini ve tedaviye cevabını izleyen hekim tarafından saptanmalıdır.