Genel olarak klasik amfoterisin B kullanımı sonucu oluşabilecek yan etkilere karşı hasta hekim tarafından izlenmelidir. Yan etkiler genellikle tedavinin kesilmesini gerektirmez. Yüksek dozlu ve uzun süreli tedavilerde dikkatli kullanılmalıdır.
Ateş, üşüme, titreme gibi akut reaksiyonlar oluşabilir. Ayrıca hipotansiyon, taşikardi, bronkospazm dispne, hipoksi ve hiperventilasyon gibi anaflaktik reaksiyonlar rapor edilmiştir. Akut reaksiyonların çoğu infüzyon hızını azaltarak ve hemen antihistaminler ve adrenal kortikosteroidler uygulayarak başarılı bir şekilde tedavi edilir.
Ciddi anaflaktik etki Amphocil kullanımının kesilmesini ve ilave destekleyici tedavi (adrenalin gibi) gerektirebilir.
Şimdiye kadar yürütülen klinik çalışmalar Amphocil'in, klasik amfoterisin B'den daha az toksik olduğunu göstermiştir.
Renal yetmezliği olan hastalarda bile Amphocil ile tedavi esnasında serum kreatinin seviyeleri uygun değerlerde kalmıştır.
Klasik amfoterisin B ile tedavi edilirken renal yetmezlik oluşan hastalar, Amphocil uygulandıktan sonra stabil kalmış veya iyileşme görülmüştür. Amphocil tedavisinde renal fonksiyonların azalması çok nadirdir. Buna rağmen klasik amfoterisin B'de olduğu gibi nefrotoksik ilaçlarla birlikte Amphocil kullanan hastaların renal fonksiyonları dikkatlice izlenmelidir.
Amphocil'in hepatik toksisite oluşturduğuna dair hiçbir rapor yoktur. Alkalen fosfataz ve bilirubin seviyelerindeki değişiklikler nadirdir.
Amphocil kullanımında bazen koagülasyon değişiklikleri, trombositopeni ve hipomagnesemi gözlenmiştir. Klasik amfoterisin B ile tedavide sık olarak görülen yan etkilerden anemi, Amphocil ile tedavi edilen hastalarda sadece %2.5 olarak görülmüştür. Bulantı, kusma, hipertansiyon baş ağrısı, bel ağrısı, diyare ve karın ağrısı da rapor edilmiştir.
